La bandera histórica de Qatar era completamente roja, en correspondencia con la bandera roja usada tradicionalmente por los musulmanes kharjitas. En el siglo XIX, el país modificó su bandera completamente roja con la adición de una franja vertical blanca en el polipasto para adaptarse a la directiva británica. Después de esta adición, el jeque Mohammed bin Thani adoptó oficialmente una bandera estampada en rojo púrpura y blanco que se parecía mucho a su derivada moderna. Se hicieron varias adiciones a la bandera de Qatar en 1932, con el borde dentado de nueve puntas, diamantes y la palabra "Qatar" integrados en su diseño. El color granate se estandarizó en 1949. En la década de 1960, Sheikh Ali Al Thani eliminó el texto y los diamantes de la bandera. 

Nueve bordes dentados separan las porciones de color granate y blanca. Significan la inclusión de Qatar como el noveno miembro de los "Emiratos reconciliados" del Golfo Pérsico al concluir el tratado entre Qatar y Gran Bretaña en 1916.

La historia del tinte púrpura en el país se remonta a varios siglos. Se ha afirmado que Qatar fue el lugar de la producción más temprana conocida de tinte para mariscos durante el gobierno de los kassitas debido a la presencia de una industria de tinte púrpura en las islas Al Khor. Qatar también era conocido por su producción de tinte púrpura durante el gobierno del Imperio Sasánida. Mohammed bin Thani, quien gobernó desde 1847 hasta 1876, propuso la creación de una bandera con un color rojo púrpura para unificar el estado y resaltar su papel histórico en la producción de tinte. En 1932, la Armada británica sugirió que se diseñara una bandera oficial. Según el gobierno de Qatar, los británicos propusieron que la bandera fuera blanca y roja, pero Qatar rechazó la coloración roja y continuó usando una mezcla de púrpura y rojo en su lugar. Según cartas del agente político británico en el golfo Pérsico a la India británica, la tela blanca se compró en Bahrein y originalmente se tiñó de rojo localmente. El tinte comprado localmente era de mala calidad y se desvanecía rápidamente, lo que hacía que la bandera tomara un color chocolate. Debido al clima desértico subtropical del país, los colores de la bandera eran propensos a ser teñidos más oscuros por el sol, lo que resultó en la eventual adopción de un color granate en 1949. La parte blanca de la bandera simboliza la paz obtenida al firmar tratados contra la piratería con los británicos.